Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC28BQ9BUN5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC28BQ9BUN5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC28BQ9BUN5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms