Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC77Q9BR77 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC77Q9BR77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC77Q9BR77 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC77Q9BR77 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms