Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED1Q99966 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CITED1Q99966 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED1Q99966 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms