Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUSP9Q99956 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUSP9Q99956 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUSP9Q99956 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP9Q99956 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms