Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3AQ99856 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID3AQ99856 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms