Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS1Q99742 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS1Q99742 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms