Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BARD1Q99728 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARD1Q99728 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BARD1Q99728 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms