Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP4Q99727 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP4Q99727 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP4Q99727 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms