Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX2Q99697 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX2Q99697 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms