Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SORT1Q99523 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SORT1Q99523 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORT1Q99523 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORT1Q99523 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms