Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 ATG36YJL185C 882 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 URA1YKL216W 945 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 SEC62YPL094C 825 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 BDF2YDL070W 1917 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 MIA40YKL195W 1212 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 SPE3YPR069C 882 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 COQ1YBR003W 1422 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 NMD5YJR132W 3147 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 YDR415CYDR415C 1125 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 COS10YNR075W 1125 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 DFR1YOR236W 636 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 COX10YPL172C 1389 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 YBR113WYBR113W 483 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 MIP1YOR330C 3765 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 ECM27YJR106W 2178 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 VMA2YBR127C 1554 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 YJL144WYJL144W 315 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 HOC1YJR075W 1191 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 RNH1YMR234W 1047 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 STT3YGL022W 2157 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 PHO3YBR092C 1404 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 LIA1YJR070C 978 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 YJR107WYJR107W 987 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 LDB7YBL006C 543 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 RFC4YOL094C 972 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG40Q99325 EDE1YBL047C 4146 nt5.59□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 YHK8YHR048W 1545 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 NOG2YNR053C 1461 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 BIO3YNR058W 1443 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 DOT1YDR440W 1749 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 DYS1YHR068W 1164 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 YKL077WYKL077W 1179 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 AIM33YML087C 939 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 TOS6YNL300W 309 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 ADH5YBR145W 1056 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 PLB3YOL011W 2061 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 FMP40YPL222W 2067 nt5.57□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 YPT1YFL038C 621 nt5.57□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 ASF1YJL115W 840 nt5.57□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 MPH3YJR160C 1809 nt5.57□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 HEM1YDR232W 1647 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 FMO1YHR176W 1299 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 YPL257WYPL257W 582 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 TKL2YBR117C 2046 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 YRB2YIL063C 984 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 KSH1YNL024C-A 219 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 CRH1YGR189C 1524 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 FAL1YDR021W 1200 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 YJR146WYJR146W 354 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 PUS4YNL292W 1212 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 GPD1YDL022W 1176 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 YNL092WYNL092W 1203 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 MRPL23YOR150W 492 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 ASN2YGR124W 1719 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 GLN3YER040W 2193 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 CYS4YGR155W 1524 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 PMT3YOR321W 2262 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG40Q99325 YOS9YDR057W 1629 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 YAR064WYAR064W 300 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 Q0010Q0010 387 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 PDR18YNR070W 4002 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 PEX3YDR329C 1326 nt5.51□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 FBA1YKL060C 1080 nt5.51□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 YNL120CYNL120C 486 nt5.51□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 RUF23RUF23 254 nt5.51□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 HXT2YMR011W 1626 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 LYS1YIR034C 1122 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 YKL102CYKL102C 306 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 TAF9YMR236W 474 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 COX5AYNL052W 462 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 SES1YDR023W 1389 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 THI2YBR240C 1353 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 KNS1YLL019C 2214 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 LCL3YGL085W 825 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 RPP1YHR062C 882 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 SQT1YIR012W 1296 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 MRPS18YNL306W 654 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 LSC1YOR142W 990 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 MSY1YPL097W 1479 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 AIM24YJR080C 1185 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 DID2YKR035W-A 615 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 OGG1YML060W 1131 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 YNL200CYNL200C 741 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 CTF19YPL018W 1110 nt5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.3 ms