Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UHRF1Q96T88 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UHRF1Q96T88 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UHRF1Q96T88 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UHRF1Q96T88 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
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