Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NODALQ96S42 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms