Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC9Q96Q05 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC9Q96Q05 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC9Q96Q05 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms