Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms