Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD6Q96NE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD6Q96NE9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD6Q96NE9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD6Q96NE9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms