Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf72Q96LT7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf72Q96LT7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms