Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHDQ96IW2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHDQ96IW2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHDQ96IW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHDQ96IW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms