Protein–RNA interactions for Protein: Q96IG2

FBXL20, F-box/LRR-repeat protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL20Q96IG2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXL20Q96IG2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXL20Q96IG2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXL20Q96IG2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms