Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH6

TMEM19, Transmembrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM19Q96HH6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM19Q96HH6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM19Q96HH6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms