Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZC2HC1AQ96GY0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZC2HC1AQ96GY0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZC2HC1AQ96GY0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms