Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BORCS6Q96GS4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BORCS6Q96GS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BORCS6Q96GS4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BORCS6Q96GS4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms