Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
IFT43Q96FT9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT43Q96FT9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT43Q96FT9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms