Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALSU1Q96EH3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALSU1Q96EH3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms