Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN1Q96DB5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RMDN1Q96DB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RMDN1Q96DB5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RMDN1Q96DB5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms