Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VTI1AQ96AJ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms