Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFT1Q96AA3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RFT1Q96AA3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFT1Q96AA3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms