Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARVELD3Q96A59 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARVELD3Q96A59 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARVELD3Q96A59 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms