Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A4Q969I6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A4Q969I6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A4Q969I6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms