Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRUQ92729 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRUQ92729 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRUQ92729 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRUQ92729 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRUQ92729 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTPRUQ92729 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms