Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABGGTAQ92696 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RABGGTAQ92696 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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