Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMO7Q8WWI1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMO7Q8WWI1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
LMO7Q8WWI1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMO7Q8WWI1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMO7Q8WWI1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMO7Q8WWI1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms