Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APH1BQ8WW43 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APH1BQ8WW43 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms