Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MGARPQ8TDB4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGARPQ8TDB4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MGARPQ8TDB4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGARPQ8TDB4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms