Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNPRQ8TBG9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNPRQ8TBG9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNPRQ8TBG9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms