Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SAMD12Q8N8I0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms