Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM99Q8N816 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM99Q8N816 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms