Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTUD6BQ8N6M0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUD6BQ8N6M0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUD6BQ8N6M0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms