Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf62Q8N4C0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf62Q8N4C0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf62Q8N4C0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms