Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFRP1Q8N474 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFRP1Q8N474 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFRP1Q8N474 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms