Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2J2Q8N2K1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms