Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00528Q8N1L1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms