Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCCP3Q8IVE0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCP3Q8IVE0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCP3Q8IVE0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms