Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUDCD3Q8IVD9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCD3Q8IVD9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD3Q8IVD9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms