Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TREML1Q86YW5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TREML1Q86YW5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms