Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM135Q86UB9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM135Q86UB9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM135Q86UB9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms