Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF39Q86UA1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF39Q86UA1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF39Q86UA1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms