Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD3Q86TU7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETD3Q86TU7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms