Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDF3Q7Z739 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YTHDF3Q7Z739 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YTHDF3Q7Z739 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms