Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
APTXQ7Z2E3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APTXQ7Z2E3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms